En la primera fase del tratamiento periodontal se eliminan las causas externas de la enfermedad, creando así las condiciones previas para la curación de la enfermedad. A continuación se trata la infección bacteriana. Esto consiste en una fase de higiene con una limpieza profesional en el gabinete odontológico así como en el adiestramiento individual del paciente en las técnicas de higiene oral. La limpieza profesional comprende la eliminación de la placa, el sarro y los patógenos causantes de la enfermedad. Una vez concluido el tratamiento inicial, el grado de inflamación de los tejidos de la cavidad oral se reduce.
